Kubernetes 部署

概述

在 kubernetes 上部署分布式任务需要安装 paddle-operator 。 paddle-operator 通过添加自定义资源类型 (paddlejob) 以及部署 controller 和一系列 kubernetes 原生组件的方式实现简单定义即可运行 paddle 任务的需求。

目前支持运行 ParameterServer (PS) 和 Collective 两种分布式任务,当然也支持运行单节点任务。

paddle-operator 安装

准备

安装 paddle-operator 需要有已经安装的 kubernetes (v1.16+) 集群和 kubectl (v1.16+) 工具。

可以通过 git clone 或者复制文件内容保存以下 文件 到本地,

deploy
├── examples
│   ├── wide_and_deep.yaml
│   ├── wide_and_deep_podip.yaml
│   └── wide_and_deep_service.yaml
└── v1
    ├── crd.yaml
    └── operator.yaml

部署 CRD

执行以下命令,

$ kubectl create -f deploy/v1/crd.yaml

通过以下命令查看是否成功,

$ kubectl get crd
NAME                                    CREATED AT
paddlejobs.batch.paddlepaddle.org       2021-02-08T07:43:24Z

部署 controller 及相关组件

注意默认部署的 namespace 为 paddle-system,如果希望在自定义的 namespace 中运行或者提交任务, 需要先在 operator.yaml 文件中对应更改 namespace 配置,其中

  • namespace: paddle-system 表示该资源部署的 namespace,可理解为系统 controller namespace;

  • Deployment 资源中 containers.args 中 –namespace=paddle-system 表示 controller 监控资源所在 namespace,即任务提交 namespace。

执行以下部署命令,

$ kubectl create -f deploy/v1/operator.yaml

通过以下命令查看部署结果和运行状态,

$ kubectl -n paddle-system get pods
NAME                                         READY   STATUS    RESTARTS   AGE
paddle-controller-manager-698dd7b855-n65jr   1/1     Running   0          1m

通过查看 controller 日志以确保运行正常,

$ kubectl -n paddle-system logs paddle-controller-manager-698dd7b855-n65jr

提交 demo 任务查看效果,

$ kubectl -n paddle-system create -f deploy/examples/wide_and_deep.yaml

查看 paddlejob 任务状态, pdj 为 paddlejob 的缩写,

$ kubectl -n paddle-system get pdj
NAME                     STATUS      MODE   PS    WORKER   AGE
wide-ande-deep-service   Completed   PS     2/2   0/2      4m4s

以上信息可以看出:训练任务已经正确完成,该任务为 ps 模式,配置需求 2 个 pserver, 2 个在运行,需求 2 个 woker,0 个在运行(已完成退出)。 可通过 cleanPodPolicy 配置任务完成/失败后的 pod 删除策略,详见任务配置。

查看 pod 状态,

$ kubectl -n paddle-system get pods

卸载

通过以下命令卸载部署的组件,

$ kubectl delete -f deploy/v1/crd.yaml -f deploy/v1/operator.yaml

注意:重新安装时,建议先卸载再安装

paddlejob 任务提交

在上述安装过程中,我们使用了 wide-and-deep 的例子作为提交任务演示,本节详细描述任务封装和提交流程供用户参考提交自己的任务。

代码准备

示例源码可在此获得,wide_and_deep ,train.py 作为程序的入口点。

本示例会在任务镜像中包含训练数据,实际应用过程中一般不会也不建议这样使用,常见用法分为以下两种:

  • 任务运行时,程序通过网络拉取数据到本地进行训练,该情形数据由程序维护,这里不需要额外配置;

  • 任务运行时,程序读取本地目录进行训练,该情形需要使用用户配置 kubernetes 支持的挂载存储,一般建议使用 pvc 抽象,详细示例见下一小节。

制作任务镜像

在 kubernetes 中使用镜像需要有可访问的镜像仓库,这里使用百度云 ccr 作为示例,用户需要自己配置。

用于生成镜像的 Dockerfile 和代码目录,

$ ls
Dockerfile   wide_and_deep

Dockerfile 内容,

$ cat Dockerfile
FROM ubuntu:18.04

RUN apt update && \
    apt install -y python3 python3-dev python3-pip

RUN python3 -m pip install paddlepaddle==2.0.0 -i https://mirror.baidu.com/pypi/simple

## 以下根据用户内容修改

ADD wide_and_deep /wide_and_deep

WORKDIR /wide_and_deep

ENTRYPOINT ["python3", "train.py"]

用户可根据实际情况更改内容和安装额外依赖。

注意:使用 gpu 训练时需要

  • 安装 gpu 版本的 paddlepaddle 和相关组件或选用 官方 docker 作为基础镜像或环境;

  • 需要在集群中安装好对应 驱动工具包 支持。

制作镜像

docker build -t registry.baidubce.com/kuizhiqing/demo-wide-and-deep:v1 .

提交镜像 (需要具有对应权限)

docker push registry.baidubce.com/kuizhiqing/demo-wide-and-deep:v1

配置任务

准备配置文件,

$ cat pdj.yaml
apiVersion: batch.paddlepaddle.org/v1
kind: PaddleJob
metadata:
  name: wide-ande-deep
spec:
  withGloo: 1
  intranet: PodIP
  cleanPodPolicy: OnCompletion
  worker:
    replicas: 2
    template:
      spec:
        containers:
          - name: paddle
            image: registry.baidubce.com/kuizhiqing/demo-wide-and-deep:v1
  ps:
    replicas: 2
    template:
      spec:
        containers:
          - name: paddle
            image: registry.baidubce.com/kuizhiqing/demo-wide-and-deep:v1

说明:

  • 提交命名需要唯一,如果存在冲突请先删除原 paddlejob 确保已经删除再提交;

  • ps 模式时需要同时配置 ps 和 worker,collective 模式时只需要配置 worker 即可;

  • withGloo 可选配置为 0 不启用, 1 只启动 worker 端, 2 启动全部(worker端和Server端), 建议设置 1;

  • cleanPodPolicy 可选配置为 Always/Never/OnFailure/OnCompletion,表示任务终止(失败或成功)时,是否删除 pod,调试时建议 Never,生产时建议 OnCompletion;

  • intranet 可选配置为 Service/PodIP,表示 pod 间的通信方式,用户可以不配置, 默认使用 PodIP;

  • ps 和 worker 的内容为 podTemplateSpec,用户可根据需要遵从 kubernetes 规范添加更多内容, 如 GPU 的配置.

更多配置示例,

apiVersion: batch.paddlepaddle.org/v1
kind: PaddleJob
metadata:
  name: wide-ande-deep
spec:
  intranet: Service
  cleanPodPolicy: OnCompletion
  worker:
    replicas: 2
    template:
      spec:
        containers:
          - name: paddle
            image: registry.baidubce.com/kuizhiqing/demo-wide-and-deep:v1
            resources:
              limits:
                nvidia.com/gpu: 1
        nodeSelector:
          accelerator: nvidia-tesla-p100
  ps:
    replicas: 2
    template:
      spec:
        containers:
          - name: paddle
            image: registry.baidubce.com/kuizhiqing/demo-wide-and-deep:v1
            resources:
              limits:
                nvidia.com/gpu: 1
        nodeSelector:
          accelerator: nvidia-tesla-p100

使用 kubectl 提交 yaml 配置文件以创建任务,

$ kubectl -n paddle-system create -f pdj.yaml

数据存储

在 kubernentes 中使用挂载存储建议使用 pv/pvc 配置,详见 persistent-volumes

这里使用 nfs 云盘作为存储作为示例,配置文件如下,

$ cat pv-pvc.yaml
---
apiVersion: v1
kind: PersistentVolume
metadata:
  name: nfs-pv
spec:
  capacity:
    storage: 10Gi
  volumeMode: Filesystem
  accessModes:
    - ReadWriteOnce
  persistentVolumeReclaimPolicy: Recycle
  storageClassName: slow
  mountOptions:
    - hard
    - nfsvers=4.1
  nfs:
    path: /nas
    server: 10.12.201.xx

---
apiVersion: v1
kind: PersistentVolumeClaim
metadata:
  name: nfs-pvc
spec:
  accessModes:
    - ReadWriteOnce
  volumeMode: Filesystem
  resources:
    requests:
      storage: 10Gi
  storageClassName: slow
  volumeName: nfs-pv

使用以下命令在 namespace paddle-system 中 创建 pvc 名为 nfs-pvc 的存储声明,实际引用为 10.12.201.xx 上的 nfs 存储。

$ kubectl -n paddle-system apply -f pv-pvc.yaml

注意 pvc 需要绑定 namespace 且只能在该 namespace 下使用。

提交 paddlejob 任务时,配置 volumes 引用以使用对应存储,

apiVersion: batch.paddlepaddle.org/v1
kind: PaddleJob
metadata:
  name: paddlejob-demo-1
spec:
  cleanPolicy: OnCompletion
  worker:
    replicas: 2
    template:
      spec:
        restartPolicy: "Never"
        containers:
          - name: paddle
            image: registry.baidubce.com/kuizhiqing/paddle-ubuntu:2.0.0-18.04
            command: ["bash","-c"]
            args: ["cd /nas/wide_and_deep; python3 train.py"]
            volumeMounts:
            - mountPath: /nas
              name: data
        volumes:
          - name: data
            persistentVolumeClaim:
              claimName: nfs-pvc
  ps:
    replicas: 2
    template:
      spec:
        restartPolicy: "Never"
        containers:
          - name: paddle
            image: registry.baidubce.com/kuizhiqing/paddle-ubuntu:2.0.0-18.04
            command: ["bash","-c"]
            args: ["cd /nas/wide_and_deep; python3 train.py"]
            volumeMounts:
            - mountPath: /nas
              name: data
        volumes:
          - name: data
            persistentVolumeClaim:
              claimName: nfs-pvc

该示例中,镜像仅提供运行环境,训练代码和数据均通过存储挂载的方式添加。